Après les deux premières guerres, la Messénie n'est encore qu'imparfaitement soumise .
Lors d'un grand tremblemnt de terre en -464 , qui secoue la Laconie , presque toutes les maisons Spartiates sont détruites ainsi que le Gymnase dans lequel la majorité des Ephèbes y laisse la vie .
Les Messéniens profitent du fait que l'armée Spartiate soit en route vers Thasos(afin de l'aider dans sa révolte conte Athène) pour se révolter .
La guerre étant difficile pour Sparte , elle doit faire appel a ses alliées , Egine , Platées , Mantinée et même Athènes . La bataille de Stenyclars coute a elle seule 300 Homoioi .
La guerre s'achève en -454 sur un compromis . Ceux qui tiennent la forteresse de l'Ithômé doivent quitter le Péloponnèse . La troisième guerre de Messénie reste un traumatisme pour Sparte. La violence à l'égard des hilotes redouble ensuite, notamment dans le cadre de la Kryptie .